Периодически перекрутив все что только можно в Unity вы захотите вернуть прежнее состояние, так вот для сброса настроек Unity открываем терминал или жмакаем Alt\^F2 и вводим:
unity --reset
А если понадобится сбросить настройки только панель Unity, то вводим:
unity --reset-icons
UPD: Удалить все настройки Unity:
gconftool-2 --recursive-unset /apps/compiz-1
unity --reset